Les stages ne sont pas systématiques. Ils dépendent de la spécialisation envisagée et, surtout, du sujet réel de la recherche.

Pour la spécialisation en « Pédagogie de la musique », le stage est requis afin de croiser la recherche théorique avec sa mise en pratique dans une ou plusieurs situation(s) pédagogique(s).

De même, pour la spécialisation en ethnomusicologie, l’enquête de terrain, qui peut être assimilée à un stage d’immersion professionnelle (le « terrain » faisant partie intégrante de la vie professionnelle de l’ethnomusicologue) est obligatoire.

La durée de ces stages varie de 35 heures à plusieurs semaines selon le besoin de formation de l’étudiant.